37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4388 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  54.24 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1678  putative transmembrane protein  52.63 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  47.62 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  48.33 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  44.26 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0548  hypothetical protein  46.88 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3904  putative transmembrane protein  49.23 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0460  hypothetical protein  44.12 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0881  hypothetical protein  56.1 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1937  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0759563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4168  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1642  putative transmembrane protein  38.71 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.115403  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3533  hypothetical protein  47.73 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2856  hypothetical protein  47.73 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.401347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0280  hypothetical protein  43.18 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1683  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.594301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>