16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0373 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0373  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  312  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15050  hypothetical protein  37.66 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197348  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2908  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5652  hypothetical protein  29.53 
 
 
257 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.372875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2111  hypothetical protein  33.82 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2347  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.248905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2425  hypothetical protein  29.58 
 
 
264 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2605  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2236  hypothetical protein  26.76 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000422278  hitchhiker  0.00000960297 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5622  hypothetical protein  29.2 
 
 
272 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00291531  normal  0.165564 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5806  hypothetical protein  29.2 
 
 
272 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000133808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8773  hypothetical protein  23.24 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1495  hypothetical protein  29.06 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1777  hypothetical protein  22.54 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5689  hypothetical protein  26.21 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11936  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>