21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5652 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5652  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.372875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2908  hypothetical protein  41.25 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2425  hypothetical protein  28.95 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2605  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2236  hypothetical protein  32.89 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000422278  hitchhiker  0.00000960297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8773  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0373  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1777  hypothetical protein  26.45 
 
 		 177 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15050  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2347  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.248905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2111  hypothetical protein  27.74 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0736  hypothetical protein  31.87 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.536387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1495  hypothetical protein  27.34 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5466  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000133808 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00291531  normal  0.165564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5175  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5087  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3705  hypothetical protein  29.25 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11936  hypothetical protein  28.7 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1361  hypothetical protein  28.8 
 
 		 206 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>