14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2236 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2236  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000422278  hitchhiker  0.00000960297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8773  hypothetical protein  38.51 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1777  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1495  hypothetical protein  32.89 
 
 
240 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5652  hypothetical protein  32.89 
 
 
257 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.372875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2908  hypothetical protein  26.43 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2347  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.248905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2605  hypothetical protein  27.97 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0373  hypothetical protein  26.76 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2425  hypothetical protein  32.38 
 
 
264 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2111  hypothetical protein  25.53 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15050  hypothetical protein  23.31 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197348  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0508  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0810934  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3706  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>