14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2425 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2425  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2908  hypothetical protein  29.02 
 
 
256 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5652  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.372875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8773  hypothetical protein  31.72 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1777  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2605  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0373  hypothetical protein  29.58 
 
 
151 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2236  hypothetical protein  32.38 
 
 
185 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000422278  hitchhiker  0.00000960297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0736  hypothetical protein  32.29 
 
 
95 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.536387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1495  hypothetical protein  27.78 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15050  hypothetical protein  25.93 
 
 
176 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197348  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2347  hypothetical protein  29.81 
 
 
145 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.248905 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4597  hypothetical protein  26.52 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.584108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5689  hypothetical protein  30.56 
 
 
271 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>