17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2445 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00231773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4023  hypothetical protein  59.66 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1911  hypothetical protein  64.71 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732075  hitchhiker  0.00000202003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1751  hypothetical protein  63.87 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2309  hypothetical protein  63.87 
 
 		 122 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0978139  hitchhiker  0.000239917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3460  hypothetical protein  63.03 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000262407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26990  hypothetical protein  67.23 
 
 		 119 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.950564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2286  hypothetical protein  68.07 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00837835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4771  hypothetical protein  48.25 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.140418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1206  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3876  hypothetical protein  39.5 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3821  hypothetical protein  38.66 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22950  hypothetical protein  45.6 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.631099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2253  hypothetical protein  36.76 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2058  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00263332  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3830  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4378  protein of unknown function DUF962  54.55 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.227882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>