13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1206 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4771  hypothetical protein  45.13 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.140418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4023  hypothetical protein  40.19 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3460  hypothetical protein  42.99 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000262407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1911  hypothetical protein  42.99 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732075  hitchhiker  0.00000202003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2309  hypothetical protein  42.06 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0978139  hitchhiker  0.000239917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1751  hypothetical protein  42.99 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2286  hypothetical protein  37.27 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00837835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26990  hypothetical protein  35.45 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.950564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2445  hypothetical protein  37.62 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00231773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3876  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3821  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22950  hypothetical protein  30.48 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.631099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>