44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1255 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 144 aa  289  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1944  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.46 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1391  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.31 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754586  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1168  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.72 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.424474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.96 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0989813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2893  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.97 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.618045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2984  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.97 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3058  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.87 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3392  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.79 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6867  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2118  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2395  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2960  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.91 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.83 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0962  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000836604  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1265  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0821  PhnB  36.07 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.697447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  34.17 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 		 132 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  33.05 
 
 		 129 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 		 164 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0294662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1024  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0996  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  33.68 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0561  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280356  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16350  hypothetical protein  42.22 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162463  normal  0.621639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4461  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.38 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  30.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219194  normal  0.368247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3345  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.77 
 
 		 395 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4843  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 		 164 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 119 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>