11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4104 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4104  hypothetical protein  100 
 
 		 837 aa  1701    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.17 
 
 		 374 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.63 
 
 		 1328 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  22.63 
 
 		 1241 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 		 426 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  30.43 
 
 		 631 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 795 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 		 432 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 475 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.11 
 
 		 934 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 963 aa  44.3  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>