15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3824 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3824  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2934  hypothetical protein  50.68 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2790  hypothetical protein  36.15 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2677  hypothetical protein  42.31 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2546  hypothetical protein  38.39 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4234  hypothetical protein  31.86 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0948  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0085  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2469  hypothetical protein  42.25 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1453  hypothetical protein  30.06 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.223858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1891  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0376  signal peptide-containing protein  34.21 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000121487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1618  hypothetical protein  40.45 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3491  hypothetical protein  31.45 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2093  hypothetical protein  31.16 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0807069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>