15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2546 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2546  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4234  hypothetical protein  33.81 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0948  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3824  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2677  hypothetical protein  40.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1453  hypothetical protein  36.65 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.223858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1891  hypothetical protein  38.61 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2790  hypothetical protein  36.11 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2787  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.778969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0085  hypothetical protein  40.43 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1618  hypothetical protein  32.54 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2093  hypothetical protein  35.81 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0807069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2934  hypothetical protein  38.1 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0376  signal peptide-containing protein  30.82 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000121487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3725  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>