12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2790 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2790  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0376  signal peptide-containing protein  51.94 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000121487  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2787  hypothetical protein  40.71 
 
 
146 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.778969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3824  hypothetical protein  36.15 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3725  hypothetical protein  33.05 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4234  hypothetical protein  36.88 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2546  hypothetical protein  36.97 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2093  hypothetical protein  31.43 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0807069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2579  hypothetical protein  28.24 
 
 
206 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2677  hypothetical protein  35.8 
 
 
147 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0073  hypothetical protein  30.3 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.356011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2934  hypothetical protein  36.84 
 
 
133 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>