22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2530 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2530  Ankyrin  100 
 
 
403 aa  842    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  37.25 
 
 
574 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  47.06 
 
 
870 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  30.4 
 
 
790 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  35.14 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30 
 
 
1061 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30 
 
 
1585 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.73 
 
 
321 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  29.84 
 
 
821 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
1198 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  31.62 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0365  gp200  33.96 
 
 
1421 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  27.78 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  26.87 
 
 
756 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0982  ankyrin  33.33 
 
 
101 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.728447  normal  0.673104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  27.51 
 
 
427 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0237  ankyrin repeat-containing protein  28.77 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  27.4 
 
 
266 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  38.75 
 
 
132 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.29 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  26.9 
 
 
581 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0286  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  29.57 
 
 
196 aa  43.1  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>