More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1634 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1634  peptidase M24  100 
 
 
393 aa  805    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  34.67 
 
 
357 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.81 
 
 
347 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  38.08 
 
 
359 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  27.87 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  34.22 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  32.9 
 
 
366 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  35.24 
 
 
364 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  28.9 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  35.5 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  33.2 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  30.6 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.3 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  30.6 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  32.35 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  32.35 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  34.62 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  28.3 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  28.3 
 
 
353 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  35.47 
 
 
356 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  34.17 
 
 
356 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  34.17 
 
 
356 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  35.04 
 
 
356 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  28.03 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  34.62 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  34.62 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  34.58 
 
 
356 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  30.59 
 
 
353 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  28.03 
 
 
353 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.03 
 
 
353 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  28.03 
 
 
353 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  28.03 
 
 
353 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  34.18 
 
 
353 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  32.32 
 
 
353 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  35.04 
 
 
356 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  32.76 
 
 
356 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  33.33 
 
 
353 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  30.97 
 
 
354 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.35 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  26.98 
 
 
354 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  30.56 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.98 
 
 
365 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  31.42 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.42 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  31.42 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  32.03 
 
 
364 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  35.02 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  31.42 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  31.42 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  31.42 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  33.73 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  34.35 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  30.97 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  29.78 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  30.97 
 
 
365 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.53 
 
 
365 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  30.53 
 
 
365 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.37 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  33.77 
 
 
362 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  34.36 
 
 
364 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  30.89 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  30.97 
 
 
388 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  32.03 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  29.78 
 
 
376 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  30.74 
 
 
363 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  32.1 
 
 
372 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  33.2 
 
 
380 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  28.09 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  33.47 
 
 
369 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  35.25 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  34.76 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  30.73 
 
 
353 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  27.43 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  32.79 
 
 
380 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  32.79 
 
 
380 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  31.93 
 
 
352 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  30.58 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  28.69 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  40.41 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  28.53 
 
 
362 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  45.31 
 
 
384 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  29.45 
 
 
367 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.51 
 
 
357 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  29.74 
 
 
374 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  25.39 
 
 
358 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  27.18 
 
 
358 aa  107  4e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  23.73 
 
 
353 aa  107  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  29.61 
 
 
355 aa  106  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  29.65 
 
 
369 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  28.88 
 
 
365 aa  106  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  33.19 
 
 
363 aa  106  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  28.79 
 
 
362 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  34.51 
 
 
374 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  32.75 
 
 
375 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  29.61 
 
 
372 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  28.02 
 
 
369 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.29 
 
 
359 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  33.19 
 
 
361 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.95 
 
 
359 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  40.85 
 
 
359 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>