117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0436 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0436  ribosomal protein L33  100 
 
 		 51 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  60.47 
 
 		 43 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  51.06 
 
 		 52 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 52 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2428  50S ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000103029  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0175  50S ribosomal protein L33  52.27 
 
 		 47 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0634965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  51.16 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0557  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 		 47 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0127832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0571  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 		 47 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000811281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  48 
 
 		 50 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  48 
 
 		 50 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0639  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000258953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0362  ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  47.73 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  52.08 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0353  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 		 48 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0266  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0327529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0261  50S ribosomal protein L33  44 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000634475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  47.92 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2065  50S ribosomal protein L33  44 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  55.81 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  44.9 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  51.92 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0469  50S ribosomal protein L33  38.64 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0484  50S ribosomal protein L33  38.64 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  47.92 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  45.83 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  43.75 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 54 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  39.58 
 
 		 49 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 49 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>