32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0660 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  64.37 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  75 
 
 
92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0003  regulatory protein, ArsR  55.32 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1426  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.134473 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1885  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.528745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0836  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0924  regulatory protein ArsR  40 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  29.73 
 
 
245 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
127 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  39.22 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  26.44 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5019  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
224 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 
119 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  38 
 
 
211 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 
133 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>