21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3628 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4587  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  27.85 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  27.85 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.1 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  32.18 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.21 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  34.48 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.46 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02216  methyltransferase  43.33 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  30.23 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1851  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  28.71 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 439 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23400  16S RNA G1207 methylase RsmC  24.09 
 
 		 411 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.498455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>