160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4918 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4918  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  73.08 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  69.81 
 
 		 403 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  69.23 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  69.23 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  69.23 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  67.31 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  67.31 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  67.92 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  62.26 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  62.26 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  38.4 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  62.26 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  62.26 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  61.54 
 
 		 399 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  61.54 
 
 		 399 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  61.54 
 
 		 399 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  61.54 
 
 		 399 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  61.54 
 
 		 399 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  61.54 
 
 		 399 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  61.54 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  58.54 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  58.54 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  58.54 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  58.54 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  58.54 
 
 		 398 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3382  hypothetical protein  65.85 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  43.21 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  43.21 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  43.21 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1419  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1465  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1678  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1687  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4846  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5364  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0949  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1437  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.515564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1488  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4917  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4934  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3267  transposase, mutator type  53.57 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  41.76 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  41.76 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  49.06 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06560  transposase  45.59 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.796022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17620  transposase  45.59 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0181204  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09270  transposase  45.59 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.681335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  46.97 
 
 		 428 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  48.48 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  56.1 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2883  transposase mutator type  42.55 
 
 		 414 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000527688  hitchhiker  0.001163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  56.1 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  56.1 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  56.1 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  60.98 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  60.98 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01800  transposase  45.45 
 
 		 418 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  60.98 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  60.98 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  60.98 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  60.98 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  60.98 
 
 		 436 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1371  transposase, mutator type  60.98 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>