173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3382 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3382  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3616  transposase  63.08 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  69.64 
 
 
308 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  69.64 
 
 
308 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  67.86 
 
 
399 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  67.86 
 
 
399 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  67.86 
 
 
399 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  67.86 
 
 
399 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  66.07 
 
 
399 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  66.07 
 
 
399 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  66.07 
 
 
399 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  66.07 
 
 
399 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  57.89 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  57.89 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  59.32 
 
 
398 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  59.32 
 
 
398 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  59.32 
 
 
398 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  59.32 
 
 
398 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  59.32 
 
 
398 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  62.71 
 
 
402 aa  80.1  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  62.71 
 
 
402 aa  80.1  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  62.71 
 
 
402 aa  80.1  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  55.26 
 
 
403 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  63.79 
 
 
402 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77.4  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  60 
 
 
405 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10260  transposase, mutator family  54.55 
 
 
417 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  60 
 
 
398 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  62.5 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  74.7  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  56.25 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  56.25 
 
 
417 aa  74.7  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  53.33 
 
 
406 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1182  transposase mutator type  55.74 
 
 
415 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1234  transposase mutator type  55.74 
 
 
415 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.199668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  57.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11065  transposase  55.88 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11223  transposase  55.88 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000146016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12534  transposase  55.88 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.922715  decreased coverage  0.00121453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13039  transposase  55.88 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7584e-95  decreased coverage  0.000658378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13135  transposase  55.88 
 
 
436 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  55 
 
 
419 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  55 
 
 
419 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  55 
 
 
419 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0836  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.976413  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1035  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000123113  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5729  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5730  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5814  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242706  hitchhiker  0.000216578 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5858  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000919553  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0039  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0431  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668856  normal  0.200495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0823  transposase, mutator type  54.1 
 
 
415 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>