More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2340 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2340  molybdopterin biosynthesis MoaE  100 
 
 
146 aa  290  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87823  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3633  molybdopterin synthase subunit MoaE  64.19 
 
 
148 aa  173  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.218035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1978  molybdopterin synthase subunit MoaE  56.85 
 
 
154 aa  163  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2260  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.11 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467293  normal  0.604415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3916  molybdopterin synthase subunit MoaE  56.08 
 
 
147 aa  160  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3103  molybdopterin-converting factor subunit 2  56.76 
 
 
147 aa  151  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231664  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1437  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.02 
 
 
169 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0696  molybdopterin converting factor, subunit 2  49.66 
 
 
163 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5210  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  51.37 
 
 
153 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.176681  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0687  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
163 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.962382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1837  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.34 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
155 aa  143  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.271451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0160  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.98 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000598821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1724  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.67 
 
 
154 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.129542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1750  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  58.62 
 
 
151 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2226  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.34 
 
 
157 aa  140  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3143  molybdopterin biosynthesis MoaE  49.66 
 
 
155 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.756812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3627  molybdopterin biosynthesis MoaE  45.51 
 
 
169 aa  140  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1027  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.33 
 
 
151 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.877253  decreased coverage  0.00128032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1547  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.97 
 
 
165 aa  140  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1036  molybdopterin synthase subunit MoaE  49.33 
 
 
150 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.960287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2020  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.28 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2077  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.66 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000346647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0058  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.14 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0904514  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1786  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.41 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.0454659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3199  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.28 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2551  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.28 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1788  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.68 
 
 
158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2273  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.69 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1962  molybdopterin synthase subunit MoaE  51.01 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000171752  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  54.41 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2729  molybdopterin synthase subunit MoaE  50.67 
 
 
150 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0618886  normal  0.244943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5151  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
158 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1423  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.35 
 
 
158 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306763  hitchhiker  0.00786823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1874  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.68 
 
 
158 aa  136  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  hitchhiker  0.0000409453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1760  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50 
 
 
158 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.242707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1715  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.95 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.168291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1507  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.68 
 
 
150 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0442  molybdopterin biosynthesis protein MoaE  46.26 
 
 
154 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6964  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.68 
 
 
189 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1248  molybdopterin synthase subunit MoaE  48.97 
 
 
172 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6229  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.68 
 
 
158 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1850  molybdopterin biosynthesis MoaE  50.68 
 
 
158 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1207  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.99 
 
 
173 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0824978  normal  0.0611166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1989  molybdopterin synthase subunit MoaE  52.35 
 
 
166 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1268  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48.99 
 
 
173 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.849988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1083  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  53.12 
 
 
153 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000999683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1917  molybdopterin biosynthesis MoaE  45.58 
 
 
163 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.925858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0050  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.66 
 
 
152 aa  133  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.617367  normal  0.0420826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1228  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.34 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1249  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  49.66 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13250  molybdopterin converting factor, large subunit  49.33 
 
 
150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.934669  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1192  molybdopterin converting factor large subunit  49.33 
 
 
150 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2167  molybdopterin biosynthesis MoaE  45.52 
 
 
148 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0935  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  46.31 
 
 
158 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1142  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0512781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1380  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2392  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1870  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0026  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2227  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.137574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2265  molybdopterin converting factor, subunit 2  48.99 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7062  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.7 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00687248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1553  molybdopterin converting factor large subunit  51.52 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2862  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  61.22 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1332  molybdopterin MPT converting factor subunit 2  48.65 
 
 
176 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1090  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  50.76 
 
 
164 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0904  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.98 
 
 
152 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1426  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.03 
 
 
190 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6403  molybdopterin biosynthesis MoaE  52.03 
 
 
190 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0976  molybdopterin converting factor, subunit 2  50.76 
 
 
164 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0548  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  44.83 
 
 
150 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2145  molybdopterin synthase subunit MoaE  47.65 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1069  molybdopterin biosynthesis MoaE  48 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0450  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  44.67 
 
 
175 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000102312  normal  0.705903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1263  molybdopterin synthase subunit MoaE  44.67 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.228678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2592  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  49.66 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4449  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  44.59 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0779  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.1 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0276  molybdopterin synthase subunit MoaE  44.59 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000334013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3745  molybdopterin synthase subunit MoaE  44.59 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0513249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1324  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  48.63 
 
 
156 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.557298  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2196  molybdopterin synthase subunit MoaE  38.86 
 
 
188 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00121089  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0104  molybdopterin biosynthesis MoaE  46.21 
 
 
156 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00530793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2377  molybdopterin synthase subunit MoaE  46.98 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1810  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  46.98 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131712  normal  0.0769758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1277  molybdopterin guanine dinucleotide biosynthesis protein MoaE  47.22 
 
 
150 aa  123  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.142074  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1359  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  48 
 
 
155 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5689  molybdopterin biosynthesis MoaE  48.65 
 
 
187 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736512  normal  0.701765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0085  molybdopterin biosynthesis MoaE  43.62 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0277  molybdopterin synthase subunit MoaE  43.92 
 
 
155 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2523  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.48 
 
 
179 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02950  hypothetical protein  43.45 
 
 
151 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03857  molybdenum cofactor biosynthesis protein E  43.45 
 
 
154 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6447  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  47.97 
 
 
187 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2815  molybdopterin synthase subunit MoaE  50 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.818732  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5396  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  52.03 
 
 
187 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0740  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  56.55 
 
 
151 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2610  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
145 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.384638  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00752  molybdopterin synthase, large subunit  46.53 
 
 
150 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>