18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0881 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  741    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  41.19 
 
 
341 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0620  hypothetical protein  38.61 
 
 
324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.691086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  35.75 
 
 
337 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2619  hypothetical protein  36.16 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  38.36 
 
 
336 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  34.91 
 
 
355 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  30.88 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  26.04 
 
 
421 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  26.3 
 
 
483 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  25.97 
 
 
465 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2888  hypothetical protein  23.91 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3030  hypothetical protein  23.91 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1887  hypothetical protein  23.95 
 
 
518 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0304  hypothetical protein  23.95 
 
 
518 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1281  hypothetical protein  22.67 
 
 
344 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1280  hypothetical protein  23.26 
 
 
344 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0608  hypothetical protein  23.05 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00667196  normal  0.552957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>