19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0316 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2619  hypothetical protein  77.45 
 
 
333 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  59.51 
 
 
341 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  46.91 
 
 
355 aa  291  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0620  hypothetical protein  48.84 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.691086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  47.02 
 
 
336 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  35.75 
 
 
376 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  28.86 
 
 
401 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  24.34 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  25 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  24.67 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3030  hypothetical protein  21.43 
 
 
530 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2888  hypothetical protein  21.12 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3475  hypothetical protein  30.77 
 
 
516 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000973715  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0304  hypothetical protein  26.11 
 
 
518 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1887  hypothetical protein  24.43 
 
 
518 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1280  hypothetical protein  28.47 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1281  hypothetical protein  28.47 
 
 
344 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  21.79 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>