13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2001 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  683    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  47.02 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2619  hypothetical protein  42.56 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  40.48 
 
 		 341 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0620  hypothetical protein  35.95 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.691086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  37.69 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  38.36 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  30.04 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  29.66 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  29.84 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  27.5 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3030  hypothetical protein  23.27 
 
 		 530 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2888  hypothetical protein  23.27 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>