15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp3030 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp3030  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1091    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2888  hypothetical protein  96.79 
 
 
530 aa  1066    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1887  hypothetical protein  33.39 
 
 
518 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0304  hypothetical protein  33.21 
 
 
518 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  31.9 
 
 
483 aa  249  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  31.9 
 
 
465 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  23.71 
 
 
401 aa  91.3  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  23.91 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  23.01 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  23.45 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  22.06 
 
 
341 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  21.43 
 
 
337 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  23.27 
 
 
336 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1280  hypothetical protein  23.44 
 
 
344 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1281  hypothetical protein  22.31 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>