16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2619 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2619  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0316  hypothetical protein  77.45 
 
 
337 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0751  hypothetical protein  55.86 
 
 
341 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000284515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0619  hypothetical protein  45.51 
 
 
355 aa  295  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0620  hypothetical protein  45 
 
 
324 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.691086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2001  hypothetical protein  42.56 
 
 
336 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0796567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0881  hypothetical protein  36.16 
 
 
376 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1196  hypothetical protein  28.06 
 
 
401 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000270508  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0210  hypothetical protein  22.89 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1137  hypothetical protein  23.15 
 
 
483 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0110326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1007  hypothetical protein  22.82 
 
 
465 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000130692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  21.05 
 
 
380 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3475  hypothetical protein  29.2 
 
 
516 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000973715  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0304  hypothetical protein  24.06 
 
 
518 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1887  hypothetical protein  22.95 
 
 
518 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  20.18 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>