16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0402 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0402  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
415 aa  800    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.30475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1851  hypothetical protein  61.36 
 
 
411 aa  450  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.257555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2099  VWA containing CoxE family protein  62.31 
 
 
403 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.242069  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0980  hypothetical protein  31.74 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000197684 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0361  hypothetical protein  33.66 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1824  hypothetical protein  33.67 
 
 
426 aa  190  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1087  hypothetical protein  29.85 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.6129  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7989  VWA containing CoxE family protein  41.56 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1555  VWA containing CoxE family protein  44.87 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  30.54 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1461  von Willebrand factor, type A  40 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2045  VWA containing CoxE family protein  38.37 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4685  VWA containing CoxE family protein  34.74 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>