9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0294 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0294  30S ribosomal protein S30e  100 
 
 		 54 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1906  30S ribosomal protein S30e  92.31 
 
 		 56 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.114651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1425  30S ribosomal protein S30e  87.04 
 
 		 54 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0292101 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1906  30S ribosomal protein S30e  80 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000323387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1185  30S ribosomal protein S30e  90.91 
 
 		 55 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1914  Ribosomal protein S30  62.75 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439006  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1721  30S ribosomal protein S30e  64.58 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.648169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0362  30S ribosomal protein S30e  82.61 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1387  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>