10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1721 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1721  30S ribosomal protein S30e  100 
 
 		 57 aa  114  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.648169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1914  Ribosomal protein S30  76.79 
 
 		 52 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1906  30S ribosomal protein S30e  72.09 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000323387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1906  30S ribosomal protein S30e  62.5 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.114651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0294  30S ribosomal protein S30e  69.77 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1425  30S ribosomal protein S30e  58.33 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0292101 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1185  30S ribosomal protein S30e  60.38 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1387  hypothetical protein  48.84 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10769  predicted protein  52.38 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32924  Ribosomal protein S30, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  54.76 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.349541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>