8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1906 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1906  30S ribosomal protein S30e  100 
 
 		 55 aa  110  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000323387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1906  30S ribosomal protein S30e  70.37 
 
 		 56 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.114651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1425  30S ribosomal protein S30e  68 
 
 		 54 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0292101 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0294  30S ribosomal protein S30e  79.55 
 
 		 54 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1721  30S ribosomal protein S30e  72.09 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.648169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1914  Ribosomal protein S30  66.67 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1185  30S ribosomal protein S30e  80 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1387  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>