9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1425 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1425  30S ribosomal protein S30e  100 
 
 		 54 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0292101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1906  30S ribosomal protein S30e  92.45 
 
 		 56 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.114651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0294  30S ribosomal protein S30e  90.91 
 
 		 54 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1906  30S ribosomal protein S30e  68 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000323387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1185  30S ribosomal protein S30e  83.64 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1914  Ribosomal protein S30  58.82 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439006  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1721  30S ribosomal protein S30e  58.33 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.648169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0362  30S ribosomal protein S30e  85.11 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1387  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>