35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0019 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 		 71 aa  140  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  87.32 
 
 		 71 aa  127  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  81.69 
 
 		 71 aa  120  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  80.33 
 
 		 71 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  54.55 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  53.97 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  53.97 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  53.97 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  52.38 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  56.45 
 
 		 62 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  50.79 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  53.12 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  47.62 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  41.79 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  51.61 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  44.26 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  51.92 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  48.44 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  49.06 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  49.06 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  54.17 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  45.9 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  55.36 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  48.33 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  42.37 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  47.17 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  41.07 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  45 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  37.31 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  42.86 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  43.33 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>