23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31424 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  70.97 
 
 
125 aa  182  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  62.59 
 
 
139 aa  173  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  64.84 
 
 
143 aa  164  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  60.29 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  49.18 
 
 
63 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  46.67 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  45 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  43.55 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  45 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  39.34 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  37.7 
 
 
63 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  37.7 
 
 
63 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  45 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  39.34 
 
 
63 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  40.32 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  35.44 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  38.46 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  32.2 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  33.87 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  35.59 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  40 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  35.85 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>