34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1149 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1149  30S ribosomal protein S17e  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0146  30S ribosomal protein S17e  75.86 
 
 		 64 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  55.74 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  55.74 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  54.1 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  48.44 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  56.9 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  50.82 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  50.82 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  53.45 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  48.39 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  46.77 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  53.7 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  50.88 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  53.7 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  48.28 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  46.03 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  46.03 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  50 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0827  ribosomal protein S17E-like  48.21 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.942401  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  55.77 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1262  Ribosomal protein S17e  43.55 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  48.15 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3917  Ribosomal protein S17E-like protein  52.17 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  46.55 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  48.15 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  44.83 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1395  30S ribosomal protein S17e  39.66 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.407431  normal  0.322807 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  40.32 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  38.3 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  38.71 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>