29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19314 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19314  predicted protein  100 
 
 
125 aa  255  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31424  Ribosomal protein S17, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  70.97 
 
 
134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00015015  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05979  40S ribosomal protein S17, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10300)  63.08 
 
 
139 aa  166  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_006686  CND02960  conserved hypothetical protein  63.41 
 
 
143 aa  163  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76215  40S ribosomal protein S17.e.B  59.13 
 
 
137 aa  146  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.480741 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0909  30S ribosomal protein S17e  47.54 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.938862  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0349  ribosomal protein S17e  50 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0019  30S ribosomal protein S17e  43.33 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1095  30S ribosomal protein S17e  42.62 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0053  30S ribosomal protein S17e  43.33 
 
 
71 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493826  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0316  30S ribosomal protein S17e  34.43 
 
 
63 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1030  30S ribosomal protein S17e  32.79 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.413697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1598  30S ribosomal protein S17e  32.79 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1450  30S ribosomal protein S17e  34.43 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0050  30S ribosomal protein S17e  41.67 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0479934 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2260  30S ribosomal protein S17e  36.71 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.252248 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0460  ribosomal protein S17E-like protein  40.98 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.160081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0766  30S ribosomal protein S17e  36.36 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00222665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0477  30S ribosomal protein S17e  35.19 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.510307  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0034  Ribosomal protein S17e  38.89 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1491  30S ribosomal protein S17e  34.85 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1889  Ribosomal protein S17E-like protein  37.04 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1246  Ribosomal protein S17e  35.59 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1459  30S ribosomal protein S17e  33.33 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1430  hypothetical protein  32.69 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0324  30S ribosomal protein S17e  35.09 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.382941  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2338  30S ribosomal protein S17e  35.19 
 
 
64 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0792439  normal  0.108991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2585  30S ribosomal protein S17e  36.54 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.140579  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1226  SSU ribosomal protein S17E  27.27 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.711601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>