11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3407 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  60.8 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  46.49 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  42.61 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  42.61 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  31.9 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  32.63 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  31 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  27.59 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>