14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2110 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  100 
 
 		 178 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  48.91 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  44.78 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0066  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  42.45 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2612  membrane protein-like protein  36.59 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00392966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  35.19 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3407  hypothetical protein  30.89 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2903  membrane protein-like protein  36.22 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.459187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  45 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2265  membrane protein-like protein  37.88 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953677  normal  0.0891239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>