15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03690  predicted membrane protein  100 
 
 
162 aa  310  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4112  putative integral membrane protein  47.55 
 
 
163 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2903  membrane protein-like protein  49.39 
 
 
169 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.459187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2612  membrane protein-like protein  51.05 
 
 
178 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00392966 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23100  predicted membrane protein  40.49 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.121843  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_004310  BR1486  hypothetical protein  32.77 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1441  hypothetical protein  32.77 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2971  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0224  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.983622  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2110  membrane protein-like protein  35.19 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0164736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1254  membrane protein-like  31.69 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.336737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  39.62 
 
 
238 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  31.79 
 
 
227 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  33.64 
 
 
249 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  40.8  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>