27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2026 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  44.34 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  36.61 
 
 		 278 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 454 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  39.08 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  31.58 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  34 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  29.47 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  33 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  36.11 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  36.11 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  34.25 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  34.72 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  44.9 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  44.9 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3731  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.959658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>