29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2520 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  44.34 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  41.18 
 
 		 278 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  43.14 
 
 		 454 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  43.33 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  36.17 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  37.63 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  36.78 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  37.33 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  37.33 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  37.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  37.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  38.36 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  34.31 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  27.68 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  33.71 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.959658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112687  normal  0.497297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00326855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  33.82 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  33.82 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>