29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0224 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  57.35 
 
 		 454 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  47.79 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  39.81 
 
 		 400 aa  83.6  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  43.88 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2612  hypothetical protein  35.09 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  41.9 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  47.67 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  34.92 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4984  hypothetical protein  39.36 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3900  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  44.16 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  44.16 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3680  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1470  hypothetical protein  37.23 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1494  hypothetical protein  37.23 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5694  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5317  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.552932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.959658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2861  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.81286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0905  hypothetical protein  39.02 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2914  hypothetical protein  32.43 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2830  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718699  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1213  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00326855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2595  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112687  normal  0.497297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>