13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3731 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3731  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  239  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.959658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0726  hypothetical protein  34.74 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.785305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  30.21 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  28.32 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  27.96 
 
 		 278 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2445  hypothetical protein  30.61 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1293  hypothetical protein  38.18 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3211  hypothetical protein  38.18 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 454 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2026  hypothetical protein  30.23 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2150  hypothetical protein  32.18 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.309277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>