24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0580 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0580  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0303842  normal  0.553094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.42 
 
 
138 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.430111  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_325  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  40.91 
 
 
132 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.168173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0363  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
132 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0381  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.68 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000348329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  39.78 
 
 
269 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.71 
 
 
269 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.71 
 
 
269 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
396 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.47 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
376 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 
434 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 
434 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.37 
 
 
423 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
430 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  31.03 
 
 
393 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  27.41 
 
 
525 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 
432 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
412 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
508 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  31.71 
 
 
525 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
508 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
385 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>