46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04287 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04287  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3444  hypothetical protein  73.91 
 
 
92 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44309  normal  0.480217 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0601  hypothetical protein  76.09 
 
 
92 aa  153  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.136445  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0556  hypothetical protein  75 
 
 
92 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  32.1 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  32.1 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  32.1 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  32.14 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  32.1 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  30.86 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  32.1 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  29.76 
 
 
98 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  31.76 
 
 
89 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  29.76 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  29.63 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1637  hypothetical protein  26.09 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00057154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  29.63 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  30.86 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  30.68 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  29.63 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  28.57 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  28.57 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  29.63 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  27.16 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0178  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  28.4 
 
 
101 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  25.93 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  28.4 
 
 
103 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  25.93 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4216  hypothetical protein  44.19 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>