88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0178 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1014  hypothetical protein  49.45 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  45.35 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  42.53 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  46.99 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  36.9 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  41.86 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  35.56 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  45.35 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  39.76 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08440  hypothetical protein  42.68 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  39.76 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  35.8 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  43.68 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  39.53 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  35.58 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  33.33 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  32.1 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  42.53 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  38.82 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2409  hypothetical protein  34.57 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  38.55 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  37.21 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0576  protein of unknown function DUF493  32.91 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  37.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  35.48 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12110  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  34.57 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1111  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1468  hypothetical protein  30.12 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1515  hypothetical protein  30.12 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  29.63 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000528768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  35.8 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  35.8 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1637  hypothetical protein  32.56 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00057154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  30.86 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1963  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  35.8 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  35.37 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1670  protein of unknown function DUF493  27.91 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  32.94 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2021  hypothetical protein  29.21 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  32.47 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04287  hypothetical protein  32.97 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3444  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44309  normal  0.480217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1578  hypothetical protein  27.16 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.979339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2373  protein of unknown function DUF493  25.93 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.591302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2285  protein of unknown function DUF493  25.93 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1177  hypothetical protein  34.52 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3154  hypothetical protein  34.52 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  29.58 
 
 		 89 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>