73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4216 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4216  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0500  protein of unknown function DUF493  95.71 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0729827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  78.57 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2901  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2891  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2276  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6234  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0413  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327313  normal  0.0225093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2803  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2941  hypothetical protein  75.71 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0382  hypothetical protein  72.86 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0622  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.534048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0222  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1371  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0440  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0460  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3190  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0056  hypothetical protein  71.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0326  hypothetical protein  75.71 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0281  hypothetical protein  70 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0224  hypothetical protein  65.71 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0188  hypothetical protein  67.14 
 
 		 99 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0239865  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0182  hypothetical protein  65.71 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1963  hypothetical protein  55.71 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1670  protein of unknown function DUF493  54.29 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0295  protein of unknown function DUF493  57.14 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.883661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4239  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0300  hypothetical protein  60.32 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4879  protein of unknown function DUF493  55.71 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0364  hypothetical protein  55.71 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0412  hypothetical protein  54.29 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0316  hypothetical protein  52.86 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0245  hypothetical protein  51.43 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3936  hypothetical protein  52.86 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0472  hypothetical protein  45.71 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0289  hypothetical protein  48.57 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.68869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0243  protein of unknown function DUF493  48.57 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0268  hypothetical protein  44.29 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1968  protein of unknown function DUF493  42.86 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  41.43 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1989  hypothetical protein  40.62 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  38.57 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  37.14 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01651  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  32.86 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0738  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0678  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0796  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00125939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0692  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0108716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0752  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0969467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1166  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332478  normal  0.283703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2995  protein of unknown function DUF493  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000919555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1853  hypothetical protein  34.29 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000034763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004226  UPF0250 protein  34.29 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000561053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00057154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3336  hypothetical protein  31.43 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000115113  normal  0.014798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0719  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  0.764617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0652819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0620  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2953  hypothetical protein  34.29 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01213  hypothetical protein  34.29 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.58222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0656  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000367197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0651  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000004684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3014  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00679596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3025  hypothetical protein  34.29 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00091395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1555  hypothetical protein  43.9 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000623107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1550  hypothetical protein  30 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1197  hypothetical protein  32.86 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04287  hypothetical protein  44.19 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3793  hypothetical protein  32.86 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>