13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0989 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0854  hypothetical protein  98.3 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0694  hypothetical protein  85.17 
 
 		 235 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0726  hypothetical protein  85.17 
 
 		 235 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153987  normal  0.122971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4778  hypothetical protein  87.77 
 
 		 233 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920095  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0726  hypothetical protein  84.75 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4491  hypothetical protein  86.02 
 
 		 235 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297213  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61980  hypothetical protein  77.59 
 
 		 231 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0638922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5392  hypothetical protein  77.59 
 
 		 231 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0980  hypothetical protein  71.31 
 
 		 230 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1264  hypothetical protein  34.76 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4442  hypothetical protein  36.69 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.520896  normal  0.812467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3601  hypothetical protein  32.95 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>