13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4491 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4491  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297213  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0726  hypothetical protein  96.17 
 
 
235 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0694  hypothetical protein  94.89 
 
 
235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0726  hypothetical protein  94.89 
 
 
235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153987  normal  0.122971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0989  hypothetical protein  86.02 
 
 
235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0854  hypothetical protein  86.02 
 
 
235 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4778  hypothetical protein  85.28 
 
 
233 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920095  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61980  hypothetical protein  76.37 
 
 
231 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0638922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5392  hypothetical protein  76.79 
 
 
231 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0980  hypothetical protein  69.75 
 
 
230 aa  321  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1264  hypothetical protein  34.52 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3601  hypothetical protein  33.52 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4442  hypothetical protein  36.69 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.520896  normal  0.812467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>