14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0726 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0694  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0726  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153987  normal  0.122971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4491  hypothetical protein  96.17 
 
 		 235 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297213  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0989  hypothetical protein  84.75 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4778  hypothetical protein  85.28 
 
 		 233 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920095  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0854  hypothetical protein  83.9 
 
 		 235 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61980  hypothetical protein  75.11 
 
 		 231 aa  344  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0638922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5392  hypothetical protein  75.11 
 
 		 231 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0980  hypothetical protein  68.91 
 
 		 230 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1264  hypothetical protein  34.52 
 
 		 189 aa  85.1  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3601  hypothetical protein  33.52 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4442  hypothetical protein  37.28 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.520896  normal  0.812467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1724  condesin subunit E  24.11 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>