More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2482 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  100 
 
 
322 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625528  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  67.7 
 
 
322 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  64.91 
 
 
322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  66.15 
 
 
337 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  66.46 
 
 
322 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  65.84 
 
 
322 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  65.84 
 
 
322 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35520  Molybdenum cofactor biosynthesis protein  56.46 
 
 
287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.3 
 
 
317 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.83 
 
 
326 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.49 
 
 
326 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  37.77 
 
 
337 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.86 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.38 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.6 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.95 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.86 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.66 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.16 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.03 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1436  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.42 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.96 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.25 
 
 
337 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.13 
 
 
344 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.32 
 
 
326 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.13 
 
 
333 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.21 
 
 
335 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.48 
 
 
326 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.81 
 
 
337 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.73 
 
 
346 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.44 
 
 
341 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  36.42 
 
 
326 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  34.11 
 
 
343 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
340 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.41 
 
 
325 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
340 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.43 
 
 
329 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.13 
 
 
341 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.43 
 
 
333 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.41 
 
 
335 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.91 
 
 
345 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.5 
 
 
349 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.22 
 
 
326 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.16 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.54 
 
 
342 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.68 
 
 
344 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.54 
 
 
342 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.16 
 
 
322 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.33 
 
 
344 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.27 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.07 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.96 
 
 
344 aa  165  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.46 
 
 
337 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.56 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.68 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.45 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.96 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.66 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.32 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.84 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  34.42 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.33 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.93 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.56 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6965  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.18 
 
 
374 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.55 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.63 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40 
 
 
340 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34 
 
 
344 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.89 
 
 
374 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.89 
 
 
374 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  38.1 
 
 
326 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0729  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.84 
 
 
340 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000041068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.77 
 
 
350 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.13 
 
 
345 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.76 
 
 
344 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.5 
 
 
408 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0273592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.17 
 
 
348 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.56 
 
 
335 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.83 
 
 
356 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.05 
 
 
327 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  34.17 
 
 
328 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.23 
 
 
322 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
331 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.29 
 
 
374 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.21 
 
 
340 aa  159  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.97 
 
 
328 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4961  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.54 
 
 
326 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.04 
 
 
359 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.56 
 
 
329 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3201  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.35 
 
 
331 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.36 
 
 
351 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.37 
 
 
326 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.15 
 
 
335 aa  158  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
328 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.81 
 
 
347 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.47 
 
 
337 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.76 
 
 
330 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  35.13 
 
 
340 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.17 
 
 
348 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>