17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_9318 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_9318  predicted protein  100 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373768  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08039  Histone H2A.Z [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUJ1]  78.81 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.68736  normal  0.469515 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119619  predicted protein  64.66 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505644  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04080  histone h2a variant, putative  70.37 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28445  histone H2A isoform 1  68.42 
 
 
138 aa  160  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.320484  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37161  predicted protein  59.84 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990123  normal  0.458805 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73490  predicted protein  61.86 
 
 
131 aa  137  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0660566  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12803  predicted protein  62.73 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.349541 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13104  predicted protein  62.73 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332383 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13304  predicted protein  62.5 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604396  normal  0.477669 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26802  histone H2A isoform 3b  60.38 
 
 
126 aa  121  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34798  histone H2A isoform 3a  60.38 
 
 
126 aa  121  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476071  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46020  histone H2A isoform 2  59.43 
 
 
138 aa  121  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00550  histone H2A-1, putative  61.21 
 
 
131 aa  120  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.331035  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03468  Histone H2A [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08844]  57.89 
 
 
132 aa  118  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503847  hitchhiker  0.000000000000165024 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86136  predicted protein  30.95 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186044  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10809  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  35.62 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>